Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms