Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms