Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf50Q5SZB4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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C9orf50Q5SZB4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf50Q5SZB4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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