Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms