Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UVSSAQ2YD98 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms