Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC18A3Q16572 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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