Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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