Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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