Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
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