Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
R3HDM1Q15032 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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