Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms