Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARB2Q14108 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARB2Q14108 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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