Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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