Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATMQ13315 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATMQ13315 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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