Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME3Q13232 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME3Q13232 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME3Q13232 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME3Q13232 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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