Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD2Q13200 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD2Q13200 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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