Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALCOCO2Q13137 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CALCOCO2Q13137 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CALCOCO2Q13137 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CALCOCO2Q13137 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CALCOCO2Q13137 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CALCOCO2Q13137 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CALCOCO2Q13137 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALCOCO2Q13137 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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