Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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FOXF1Q12946 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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FOXF1Q12946 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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FOXF1Q12946 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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