Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 SPC29YPL124W 762 nt2.64□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 RGL1YPL066W 1440 nt2.64□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 RSE1YML049C 4086 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 AYT1YLL063C 1425 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 RVS161YCR009C 798 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 AHC2YCR082W 387 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 LAG1YHL003C 1236 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 FYV7YLR068W 456 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 MRPL44YMR225C 297 nt2.63□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 ORC1YML065W 2745 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YDR193WYDR193W 399 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 IRC4YDR540C 540 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YJL007CYJL007C 315 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 NOP15YNL110C 663 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 FPR1YNL135C 345 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 CRS5YOR031W 210 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 HAA1YPR008W 2085 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 MRD1YPR112C 2664 nt2.62□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YBT1YLL048C 4986 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 NDD1YOR372C 1665 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 BNA7YDR428C 786 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YJR023CYJR023C 402 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 RGM1YMR182C 636 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 PDR1YGL013C 3207 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 DPB11YJL090C 2295 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 SMB1YER029C 591 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 BIG1YHR101C 1008 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 RPI1YIL119C 1224 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 CTK3YML112W 891 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 COQ10YOL008W 624 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 LCL1YPL056C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 ECM25YJL201W 1800 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 ARP8YOR141C 2646 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 KSP1YHR082C 3090 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 GPI8YDR331W 1236 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 RPF1YHR088W 888 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 CAT5YOR125C 702 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 YBR197CYBR197C 654 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE4Q12455 SSY1YDR160W 2559 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 PSO2YMR137C 1986 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 YDL032WYDL032W 312 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 VAR1Q0140 1197 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 COX13YGL191W 390 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 YIL058WYIL058W 285 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 RNP1YLL046C 750 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 RMP1YLR145W 606 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 COX14YML129C 213 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 SWM2YNR004W 441 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 YPL197CYPL197C 414 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 YPL205CYPL205C 345 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 KEL2YGR238C 2649 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 SKP2YNL311C 2292 nt2.58□□□□□ -2
SPE4Q12455 SSE1YPL106C 2082 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 YPR089WYPR089W 2667 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 UTP14YML093W 2700 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 TPM2YIL138C 486 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 YKL066WYKL066W 444 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 CMS1YLR003C 876 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 YLR171WYLR171W 390 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 SYM1YLR251W 594 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 DDR48YMR173W 1293 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 TRM7YBR061C 933 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.57□□□□□ -2
SPE4Q12455 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
SPE4Q12455 CAJ1YER048C 1176 nt2.56□□□□□ -2
SPE4Q12455 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.56□□□□□ -2
SPE4Q12455 PKR1YMR123W 369 nt2.56□□□□□ -2
SPE4Q12455 RPB11YOL005C 363 nt2.56□□□□□ -2
SPE4Q12455 ASM4YDL088C 1587 nt2.56□□□□□ -2
SPE4Q12455 MDM32YOR147W 1869 nt2.56□□□□□ -2
SPE4Q12455 YJL070CYJL070C 2667 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 PES4YFR023W 1836 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 YPS5YGL259W 498 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 ECL1YGR146C 636 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 RNR4YGR180C 1038 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 YLR379WYLR379W 375 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 URA10YMR271C 684 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 YOR055WYOR055W 435 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 RPS12YOR369C 432 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 SDC25YLL016W 3147 nt2.55□□□□□ -2
SPE4Q12455 FLO11YIR019C 4104 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 ROY1YMR258C 1662 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 BI2Q0110 1272 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 PEP8YJL053W 1140 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 DGK1YOR311C 873 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 IRC16YPR038W 360 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 ESC1YMR219W 4977 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 PTP3YER075C 2787 nt2.54□□□□□ -2
SPE4Q12455 SNU114YKL173W 3027 nt2.53□□□□□ -2
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