Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YAK1YJL141C 2424 nt3.63□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 MIT1YEL007W 2001 nt3.63□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RLF2YPR018W 1821 nt3.63□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RPS17BYDR447C 411 nt3.63□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RMT2YDR465C 1239 nt3.63□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.63□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YEL025CYEL025C 3567 nt3.63□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 SSY1YDR160W 2559 nt3.62□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 GNT1YOR320C 1476 nt3.62□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 ECM5YMR176W 4236 nt3.62□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 CIN8YEL061C 3003 nt3.62□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 PEP8YJL053W 1140 nt3.62□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 ESF2YNR054C 951 nt3.62□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 GCN1YGL195W 8019 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YOL057WYOL057W 2136 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YSW1YBR148W 1830 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RPC10YHR143W-A 213 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 SEC22YLR268W 645 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YPL276WYPL276W 438 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YPR039WYPR039W 336 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 TCP1YDR212W 1680 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 FLO9YAL063C 3969 nt3.61□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YNL034WYNL034W 1839 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 ROM1YGR070W 3468 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 TSC11YER093C 4293 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 VAS1YGR094W 3315 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YGR107WYGR107W 450 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RPS24BYIL069C 408 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RPL8BYLL045C 771 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 APC2YLR127C 2562 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 MDM1YML104C 3384 nt3.6□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 NDD1YOR372C 1665 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RPS20YHL015W 366 nt3.59□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 NSP1YJL041W 2472 nt3.59□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 TRM2YKR056W 1920 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 PSK2YOL045W 3306 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YER189WYER189W 369 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 FYV4YHR059W 393 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YIL058WYIL058W 285 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 AIM32YML050W 936 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 MRPL50YNR022C 420 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 DRS2YAL026C 4068 nt3.58□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.57□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.57□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 MET5YJR137C 4329 nt3.57□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YAR070CYAR070C 300 nt3.57□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.57□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.57□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 GIS4YML006C 2325 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 GCD10YNL062C 1437 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 CAJ1YER048C 1176 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 SPT4YGR063C 309 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YLR434CYLR434C 384 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 RPS7BYNL096C 573 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YNL146WYNL146W 303 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 RPA190YOR341W 4995 nt3.56□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 DIE2YGR227W 1578 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 BNA4YBL098W 1383 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 IKI3YLR384C 4050 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 BAT1YHR208W 1182 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YOR121CYOR121C 306 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 MKT1YNL085W 2493 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 DBP10YDL031W 2988 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 VTC4YJL012C 2166 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YIL166CYIL166C 1629 nt3.55□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 HPA3YEL066W 540 nt3.54□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 PET191YJR034W 327 nt3.54□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 APC9YLR102C 798 nt3.54□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 SWM2YNR004W 441 nt3.54□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YSY6YBR162W-A 198 nt3.54□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 CHS2YBR038W 2892 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 BAS1YKR099W 2436 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 TIM11YDR322C-A 291 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 GPI8YDR331W 1236 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 SOD1YJR104C 465 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 TIM8YJR135W-A 264 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YLR012CYLR012C 300 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 UNG1YML021C 1080 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 YOR146WYOR146W 306 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 ECM25YJL201W 1800 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 BMS1YPL217C 3552 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 ATG21YPL100W 1491 nt3.53□□□□□ -1.84
SSF2Q12153 SPC72YAL047C 1869 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 RTT102YGR275W 474 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 RPL40BYKR094C 387 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 ICY1YMR195W 384 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YBL071CYBL071C 309 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.52□□□□□ -1.85
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