Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP1B1Q10567 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms