RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
Predictions only
Length
590 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
YTA7
YGR270W
4140 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
RPN1
YHR027C
2982 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
YMR317W
YMR317W
3423 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
CSR2
YPR030W
3366 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
VBA4
YDR119W
2307 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
YDR102C
YDR102C
333 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
YFL032W
YFL032W
321 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
LSM2
YBL026W
288 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
TIM18
YOR297C
579 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
SIZ1
YDR409W
2715 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
ALY1
YKR021W
2748 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
NOP4
YPL043W
2058 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
APC11
YDL008W
498 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
RRT13
YER066W
558 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
RPL29
YFR032C-A
180 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
YOR146W
YOR146W
306 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
RPS12
YOR369C
432 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
YPL039W
YPL039W
951 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
MDN1
YLR106C
14733 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
BNI4
YNL233W
2679 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
TAO3
YIL129C
7131 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
VTC4
YJL012C
2166 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SGO1
Q08490
RAD5
YLR032W
3510 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YCR018C-A
YCR018C-A
255 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
COX14
YML129C
213 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YMR320W
YMR320W
306 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YPL276W
YPL276W
438 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YCG1
YDR325W
3108 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
DIE2
YGR227W
1578 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
AUS1
YOR011W
4185 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YER066C-A
YER066C-A
501 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
PAU23
YLR037C
375 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YBL065W
YBL065W
345 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
RPB11
YOL005C
363 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
MED1
YPR070W
1701 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
REG1
YDR028C
3045 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
MNT3
YIL014W
1893 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
FAA2
YER015W
2235 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
STT4
YLR305C
5703 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
MES1
YGR264C
2256 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
GPI8
YDR331W
1236 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
PRE4
YFR050C
801 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YHR063W-A
YHR063W-A
336 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YHR214W-A
YHR214W-A
486 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
PET191
YJR034W
327 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YAR068W
YAR068W
486 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
PRE8
YML092C
753 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YMR290W-A
YMR290W-A
348 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
GOT1
YMR292W
417 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
DGK1
YOR311C
873 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
GCN1
YGL195W
8019 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
FAS1
YKL182W
6156 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YDL180W
YDL180W
1644 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
NUP60
YAR002W
1620 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
DBP10
YDL031W
2988 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
SPG3
YDR504C
384 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YEL018C-A
YEL018C-A
534 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
RAD6
YGL058W
519 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YIL012W
YIL012W
342 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
LSM8
YJR022W
330 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
HEM4
YOR278W
828 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YPR077C
YPR077C
372 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
snR36
snR36
182 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
POL3
YDL102W
3294 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
ARK1
YNL020C
1917 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
TMA108
YIL137C
2841 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
POL2
YNL262W
6669 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
FAR1
YJL157C
2493 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
NAB6
YML117W
3405 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
tW(UCA)Q
tW(UCA)Q
74 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YKL183C-A
YKL183C-A
213 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
NTO1
YPR031W
2247 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
SET1
YHR119W
3243 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
YOR296W
YOR296W
3870 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
RPS23A
YGR118W
438 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
RPS21B
YJL136C
264 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
BIL1
YOR304C-A
231 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
RPA135
YPR010C
3612 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
TRZ1
YKR079C
2517 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
MDM32
YOR147W
1869 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
STE5
YDR103W
2754 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SGO1
Q08490
VPS3
YDR495C
3036 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
VHR2
YER064C
1518 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
RPL30
YGL030W
318 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
NOP19
YGR251W
591 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
RPS7B
YNL096C
573 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
SPC72
YAL047C
1869 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
YLR001C
YLR001C
2589 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
KAP104
YBR017C
2757 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
MAK21
YDR060W
3078 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
SPO71
YDR104C
3738 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
ENA5
YDR038C
3276 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
DPB11
YJL090C
2295 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
ATP17
YDR377W
306 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
YJL202C
YJL202C
348 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
YLR031W
YLR031W
561 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
JIP3
YLR331C
378 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
JLP2
YMR132C
627 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
SSN8
YNL025C
972 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SGO1
Q08490
YNL337W
YNL337W
255 nt
3.2
□□□□□ -1.9
First
Previous
58
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.1 ms