Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YTA7YGR270W 4140 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 RPN1YHR027C 2982 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 YMR317WYMR317W 3423 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 CSR2YPR030W 3366 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 VBA4YDR119W 2307 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 YDR102CYDR102C 333 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 YFL032WYFL032W 321 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 LSM2YBL026W 288 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 TIM18YOR297C 579 nt3.29□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 SIZ1YDR409W 2715 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 ALY1YKR021W 2748 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 NOP4YPL043W 2058 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 APC11YDL008W 498 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 RRT13YER066W 558 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 RPL29YFR032C-A 180 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 YOR146WYOR146W 306 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 RPS12YOR369C 432 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 YPL039WYPL039W 951 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 MDN1YLR106C 14733 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 BNI4YNL233W 2679 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 TAO3YIL129C 7131 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 VTC4YJL012C 2166 nt3.28□□□□□ -1.88
SGO1Q08490 RAD5YLR032W 3510 nt3.27□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt3.27□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 COX14YML129C 213 nt3.27□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YMR320WYMR320W 306 nt3.27□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YPL276WYPL276W 438 nt3.27□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YCG1YDR325W 3108 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 DIE2YGR227W 1578 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 AUS1YOR011W 4185 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 PAU23YLR037C 375 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YBL065WYBL065W 345 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 RPB11YOL005C 363 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 MED1YPR070W 1701 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 REG1YDR028C 3045 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 MNT3YIL014W 1893 nt3.26□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 FAA2YER015W 2235 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 STT4YLR305C 5703 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 MES1YGR264C 2256 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 GPI8YDR331W 1236 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 PRE4YFR050C 801 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 PET191YJR034W 327 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YAR068WYAR068W 486 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 PRE8YML092C 753 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 GOT1YMR292W 417 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 DGK1YOR311C 873 nt3.25□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 GCN1YGL195W 8019 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 FAS1YKL182W 6156 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YDL180WYDL180W 1644 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 NUP60YAR002W 1620 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 DBP10YDL031W 2988 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 SPG3YDR504C 384 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 RAD6YGL058W 519 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YIL012WYIL012W 342 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 LSM8YJR022W 330 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 HEM4YOR278W 828 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YPR077CYPR077C 372 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 snR36snR36 182 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 POL3YDL102W 3294 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 ARK1YNL020C 1917 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 TMA108YIL137C 2841 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 POL2YNL262W 6669 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 FAR1YJL157C 2493 nt3.24□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 NAB6YML117W 3405 nt3.23□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.23□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt3.23□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 NTO1YPR031W 2247 nt3.23□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 SET1YHR119W 3243 nt3.23□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 YOR296WYOR296W 3870 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 RPS23AYGR118W 438 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 RPS21BYJL136C 264 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 BIL1YOR304C-A 231 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 RPA135YPR010C 3612 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 TRZ1YKR079C 2517 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 MDM32YOR147W 1869 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 STE5YDR103W 2754 nt3.22□□□□□ -1.89
SGO1Q08490 VPS3YDR495C 3036 nt3.21□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 VHR2YER064C 1518 nt3.21□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RPL30YGL030W 318 nt3.21□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 NOP19YGR251W 591 nt3.21□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RPS7BYNL096C 573 nt3.21□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SPC72YAL047C 1869 nt3.21□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YLR001CYLR001C 2589 nt3.21□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 KAP104YBR017C 2757 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 MAK21YDR060W 3078 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SPO71YDR104C 3738 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 ENA5YDR038C 3276 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 DPB11YJL090C 2295 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 ATP17YDR377W 306 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YJL202CYJL202C 348 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YLR031WYLR031W 561 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 JIP3YLR331C 378 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 JLP2YMR132C 627 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SSN8YNL025C 972 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YNL337WYNL337W 255 nt3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.1 ms