Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms