Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms