Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDSRQ06136 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDSRQ06136 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KDSRQ06136 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDSRQ06136 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDSRQ06136 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms