Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms