Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms