Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRG1Q02297 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms