Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN2Q02246 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN2Q02246 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms