Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms