Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKD1P98161 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKD1P98161 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKD1P98161 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKD1P98161 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PKD1P98161 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKD1P98161 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKD1P98161 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PKD1P98161 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKD1P98161 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKD1P98161 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKD1P98161 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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