Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTG1P63261 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms