Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVFC1P60507 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms