Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMP4BP1P59074 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms