Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BACE1P56817 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BACE1P56817 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BACE1P56817 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms