Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP9P55211 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP9P55211 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP9P55211 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP9P55211 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms