Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELLP55199 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELLP55199 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELLP55199 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELLP55199 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELLP55199 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELLP55199 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELLP55199 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELLP55199 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms