Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms