Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms