Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms