Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP4P49662 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP4P49662 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP4P49662 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP4P49662 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms