Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms