Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5OP48047 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5OP48047 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms