Protein–RNA interactions for Protein: P38138

ROT2, Glucosidase 2 subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT2P38138 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 NAB3YPL190C 2409 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 SRO77YBL106C 3033 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 TIM11YDR322C-A 291 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 TSA2YDR453C 591 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 YPS5YGL259W 498 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 YML037CYML037C 1023 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 SEN15YMR059W 387 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 YNL046WYNL046W 519 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 NOP15YNL110C 663 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 SWM2YNR004W 441 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 RPB11YOL005C 363 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 SIP3YNL257C 3690 nt2.6□□□□□ -1.99
ROT2P38138 NPR3YHL023C 3441 nt2.59□□□□□ -1.99
ROT2P38138 FUS1YCL027W 1539 nt2.59□□□□□ -1.99
ROT2P38138 TIF35YDR429C 825 nt2.59□□□□□ -1.99
ROT2P38138 RNR4YGR180C 1038 nt2.59□□□□□ -1.99
ROT2P38138 CMC2YBL059C-A 330 nt2.59□□□□□ -1.99
ROT2P38138 LEE1YPL054W 906 nt2.59□□□□□ -1.99
ROT2P38138 NSL1YPL233W 651 nt2.59□□□□□ -1.99
ROT2P38138 COG3YER157W 2406 nt2.59□□□□□ -2
ROT2P38138 APC2YLR127C 2562 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 DPB11YJL090C 2295 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 SRB8YCR081W 4284 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 IES5YER092W 378 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 RMP1YLR145W 606 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 PEP12YOR036W 867 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 MSS18YPR134W 807 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 IKI3YLR384C 4050 nt2.58□□□□□ -2
ROT2P38138 GPI17YDR434W 1605 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 MDM32YOR147W 1869 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 GPI19YDR437W 423 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 YIL054WYIL054W 318 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 YJR079WYJR079W 330 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 VPH2YKL119C 648 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 TEN1YLR010C 483 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 YPL039WYPL039W 951 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 YPL150WYPL150W 2706 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 SEC26YDR238C 2922 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 NPR1YNL183C 2373 nt2.57□□□□□ -2
ROT2P38138 KIN82YCR091W 2163 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 SMB1YER029C 591 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YER079WYER079W 633 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YLR269CYLR269C 351 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YLR334CYLR334C 381 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YPL197CYPL197C 414 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 RGR1YLR071C 3249 nt2.56□□□□□ -2
ROT2P38138 YLR001CYLR001C 2589 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 GIN4YDR507C 3429 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 RPO41YFL036W 4056 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 YCR064CYCR064C 411 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 ADK1YDR226W 669 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 RPS17BYDR447C 411 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 YER135CYER135C 393 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 TPM2YIL138C 486 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 PEP8YJL053W 1140 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 YJR023CYJR023C 402 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 RPL8BYLL045C 771 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 AYT1YLL063C 1425 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 TIF11YMR260C 462 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 YNL034WYNL034W 1839 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 RLF2YPR018W 1821 nt2.55□□□□□ -2
ROT2P38138 ROY1YMR258C 1662 nt2.54□□□□□ -2
ROT2P38138 IRC4YDR540C 540 nt2.54□□□□□ -2
ROT2P38138 NBL1YHR199C-A 222 nt2.54□□□□□ -2
ROT2P38138 RPL20AYMR242C 519 nt2.54□□□□□ -2
ROT2P38138 YOR248WYOR248W 303 nt2.54□□□□□ -2
ROT2P38138 SPB1YCL054W 2526 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 TRM2YKR056W 1920 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 YHR138CYHR138C 345 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 SIP18YMR175W 240 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 URA10YMR271C 684 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 PEX17YNL214W 600 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 DGK1YOR311C 873 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 YPR203WYPR203W 309 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 RNH70YGR276C 1662 nt2.53□□□□□ -2
ROT2P38138 SAP1YER047C 2694 nt2.52□□□□□ -2.01
ROT2P38138 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.52□□□□□ -2.01
ROT2P38138 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.52□□□□□ -2.01
ROT2P38138 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.52□□□□□ -2.01
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