Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT9P35527 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT9P35527 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT9P35527 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT9P35527 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms