Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCGF2P35227 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms