Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LIAS-204ENST00000424936 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TCEAL1-202ENST00000372625 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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