Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms