Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms