Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms